IFITM3 protein određuje otpornost na konjski virus

Simptomi

Linda Wakim i njezini kolege iz laboratorija profesora Jose Villadangos, Zavod za biokemiju i molekularnu biologiju i Odjel za mikrobiologiju i imunologiju, vjeruju da su pronašli novi trag zašto neki ljudi nositi s infekcijom bolji od drugih.

Laboratorij se bavi proučavanjem "zaštitnih uređaja" T-stanica koje se nalaze na otvorenim dijelovima tijela, kao što su koža i sluznica, te su usmjerene na sprečavanje razvoja infekcije. Kao što je poznato, T stanice u nekim slučajevima unaprijed mogu otkriti viruse i inficirane stanice i uništiti ih prije nego što virus počne koristiti stanicu domaćina radi reprodukcije.

Istraživači su otkrili da ove T stanice sadrže IFITM3 protein na površini što ih čini otpornijom na virusnu infekciju, uključujući i influencu. Rezultati su objavljeni u Nature Immunology.

„Ako smo saznali kako povećati broj i trajanje života tih T-stanica koje izlučuju proteine ​​IFITM3, možemo usavršiti cjepiva koje će generirati više održiv generacije T-stanica koje mogu pružiti najbolju zaštitu za dugo vremena.”, Rekao je profesor Villadangos.

Dr. Wakim je rekao: "U ovom trenutku pokušavamo shvatiti zašto samo neke T stanice, a ne sve one, izražavaju ovu zaštitnu molekulu. Oni vjerojatno primaju specifični signal iz citokina ili površine molekule u tkivima. Ako identificiramo te kemijske signale, moći ćemo ih koristiti u budućim cjepivima prilikom izrade cjepiva. "

Izvor: Sveučilište u Melbourneu

Linezolid - sintetički antibiotik protiv teških infekcija

Linezolid, linezolid - antibiotik širokog spektra

Znanstvenici su otkrili novi antivirusni protein

Znanstvenici sa Sveučilišta u Melbourneu i Walter i Eliza Hall Institute (WEHI) u Australiji otkrili su novi protein koji štiti od virusnih infekcija, uključujući i influencu.

Linda Wakim, zajedno s kolegama, vjeruje da imaju razumijevanje zašto se neki ljudi bolje ponašaju s infekcijama od drugih. Laboratorij proučava "zaštitne uređaje" T stanica koje se nalaze na površinama tijela - kože i sluznice. T stanice prepoznaju stanice zaražene virusom i ubiju ih prije nego što se virus može reproducirati i širiti na druge stanice.

Istraživači su pokazali da ove stanice sadrže IFITM3 protein, što ih čini otpornijim na virusne infekcije.

„Ako gledamo kako povećati broj i trajanje života T-stanica koje izlučuju IFITM3, to može dovesti do poboljšane cjepiva koje pridonose razvoju održivih T-stanica sposobnih za davanje najbolju zaštitu za duže vrijeme”, - kaže profesor Villadangos.

Dr. Wakim je rekao:
"Trenutno pokušavamo shvatiti zašto neke T stanice, ali ne i druge, proizvode ove zaštitne molekule. Vjerojatno se pokoravaju nekom obliku kemijskog signala (citokina ili površinske molekule) u tkivu koja se nalazi, što uzrokuje izraz IFITM3. Ako definirate ove kemijske putove, moći ćemo ih inkorporirati u buduća cjepiva. "

Mutacije u ljudskim genima, povećavajući rizik od teških infekcija gripe

Primljeno: 2015-03-14 Prihvaćeno za tisak: 2015-07-22 Objavljeno: 2015-08-31

OI Kiselev 1, AB Komissarov 1, OS Konshina 1 #, MN Dmitrieva 1, E. G. Deeva 1, TV Sologub 1, VI Pokrovsky 2

1 FGBU "Institut za gripu" Ministarstva zdravstva Rusije, Sankt Peterburg, Ruska Federacija

2 FBUN "Središnji institut za epidemiologiju" Rospotrebnadzora, Moskva, Rusija

# Za dopisivanje: 197376, St. Petersburg, ul. Prof. Popova 15/17, FGBU "Institut za gripu" Ministarstva zdravstva Rusije, E.mail: [email protected]

sažetak

Sustav genetske kontrole imunog odgovora na infekciju gripe i funkcije gena omogućuje razviti sustav liječenja gripe s naglaskom na fenotipu mutacija na temelju genetske predispozicije pojedinca na teške bolesti i / ili razvoj komplikacija.

sažetak

Sustav genetske kontrole urođenog, imunološkog sustava, imunološkog sustava, imunološkog sustava, organizma,

uvod

Analiza strukture pobola i smrtnosti od gripe u svijetu se temelji na istraživanju u dobnoj i identifikacije rizičnih skupina [1-6]. Međutim, očito je da pobol i smrtnost su u velikoj mjeri ovisi o genetskim karakteristikama pojedinih populacija i etničkih skupina. S jedne strane, izravna veza morbiditet od influence c haplotip HLA (Human Leucocyte Antigeni), drugi - analiza polimorfizma većeg broja gena koji utječu na razinu zaštite od virusa, potvrđuje da je doprinos pojedinih mutacija i SNP-a (single-nukleotid polimorfizma, SNP) u incidencija i smrtnost od gripe znatno je veća nego što je prethodno mislilo [7-12]. Opsežna istraživanja u području populacijske genetike i podložnost gripe pokazuju da mjere protiv epidemije u različitim dijelovima zemlje treba planirati u skladu s genetskim karakteristikama stanovništva. Također je vidljivo da je razvoj cjepiva biti svjestan svojih „genetske” usredotočiti na velike populacije i vjerojatnosti lošeg odgovora - sve do njegove odsutnosti - na cijepljenje kod ljudi s određenim haplotipova HLA [11, 12]. Na temelju analize genskih polimorfizama, možemo reći da je u terapiji gripe - u kontekstu masovnog obolijevanja, karakterističan za pandemija - potrebno je uzeti u obzir moguće prirodu kompliciran tijek bolesti povezane s defektom nekog imuniteta i antivirusna zaštita. Razumijevanje genetske osnove patologije zaraznih bolesti, uključujući gripu, može se značajno promijeniti kao praksu cijepljenja, kao i osnove terapije.

U tom smislu potrebno je sustaviti dostupne informacije o strukturi gena i genetskih markera, karakterističnih za slučajeve neodgovarajućih ili patoloških reakcija u slučaju influence i povezanih infekcija.

Ispod su popis i karakteristike gena, SNP u kojima je povezana s povećanom osjetljivošću na infekciju influence ili teškim bolestima [9, 13, 14].

Uloga polimorfizma gena za interferon-inducibilni transmembranski protein 3 (IFITM3) u zaraznoj patologiji

Gene (IFITM3). Jedan od važnih otkrića u razdoblju od posljednjeg pandemije vremena, može se smatrati identifikaciju polimorfizma u genu za IFITM3 u skupinama bolesnika s pandemija gripe A (H1N1) pdm09 uzrokovati ozbiljne tijek bolesti, u nekim slučajevima s fatalnim komplikacija (Slika 1) [9, 13-21].

Geni IFITM3 pripada obitelji gena čija je aktivnost inducirana interferonima tipa I (IFN). IFITM3 protein se odnosi na transmembranske proteine ​​i uključuje dvije transmembranske domene. Njegova funkcionalna aktivnost je povezana s otpornošću na sojevima A (H1N1) i mnoge druge pdm09 infekcije, uključujući vrućicu i denga groznice, hemoragijskog virusa zapadnoga Nila [13]. IFITM3 proteina postoji u različitim izoformama, a jedan od njih, zajednički dovoljno nedostaju N-terminalna domena (Slika 2), [18-21]. Analiza ovog fenomena dovelo do identifikacije mutacija na vezno mjesto, što određuje osjetljivost na ovim virusom [19, 20].

U analizi mehanizma djelovanja IFITM3 pokazala da je ovaj protein blokira stanice inficirane (prodiranja virusa u stanicu), na razini endocitozu virusnih čestica [22]. Kasnije postavili svoju ulogu u suzbijanju infekcija uzrokovanih virusima, kao što su, Ebola virusom humane imunodeficijencije tipa I (HIV-1), hepatitis C, Dengue groznica [13]. Također je pokazano da suprimira IFITM3 ovisi S-protein endocitoze Srednji Istok respiratorni sindrom koronavirus (Middle East, sindrom respiratornog meri) [23], čime se sprečava prodiranje virusnog genetskog materijala u stanicu.

Širok spektar antivirusne aktivnosti IFITM3 proteina objašnjava činjenicom da ima snažan utjecaj na stabilnost ATPaze kompleksa vakuola (u-ATPaze) i endosoma. U endocitozi virusa važnu ulogu igra interakcija β-ATPaze s endosomima, što dovodi do promjene lokalizacije klathrina i smanjenja pH [24]. Ovaj proces ima ključnu ulogu u infekciji stanica, pa je posebno atraktivan kao terapeutski cilj. Utvrđeno je da su klasični inhibitori klatrina i b-ATPaze učinkoviti inhibitori reprodukcije virusa i pripadaju širokim spektrom lijekova. Pokazalo se da ovaj popis uključuje Arbidol [25]. Tako je u Arbidolu identificiran još jedan mehanizam djelovanja, koji očito određuje antivirusnu aktivnost širokom rasponu virusa. Međutim, mehanizam antivirusne zaštite ne može biti potpuno opravdanje mehanizama IFITM3 interferencije s virusima na razini putanja klathrina za internalizaciju virusnih čestica u ranoj fazi infekcije.

Tijekom ekspresije gena IFITM3 mogu formirati dvije različite transkripti: puni i skraćeni varijanta koja kodira slijed aminokiselina proteina, koji su bez N-terminalnog fragmenta dužine od 21 aminokiselinski ostatak [21].

Općenito, IFITM3 protein je restrikcijski faktor za virusnu reprodukciju, koji djeluje kroz formiranje stanične otpore na viruse iz različitih obitelji. No, detaljni mehanizmi za stvaranje antivirusne zaštite u stanicama, unatoč otkriću IFITM3 proteina, ostaju nepoznati. Nekoliko studija [18-20] pokazalo je da kod miševa s nokautiranim IFITM3 genima tijek infekcije gripe je teži nego kod životinja s divljim tipom tog gena. U ljudskoj populaciji, mutacija je poznata za ovaj gen - zamjenu T s C u mjestu spajanja introna I [18].

Odnos ove mutacije s europskom populacijom proučen je tijekom infekcije gripe uzrokovanim A (H1N1) pdm09 virusom i učestalosti hospitalizacije, što se smatra kriterijem za složeni razvoj infekcije [19]. Pacijenti hospitalizirani s kompliciranom influencom i teškim tijekovima bolesti pokazali su povećanu učestalost homozigosnosti nad rijetkim alelom C IFITM3 gena. Učestalost SNP rs12252-C u teškim bolesnicima bila je 5,3% u usporedbi s 0,3% za europske populacije. Zanimljivo je da je u populacijama Kine incidencija SNP rs12252-C bila znatno veća. Dakle, ako je u prosjeku učestalost HS genotipa bila oko 25%, kod pacijenata iz Kine s teškim oblikom influence, pojava genotipa HS dostigla je 69% (Slika 3).

Gore navedeni rezultati o učestalosti alela IFITM3 gena dobiveni su od autora u statističkoj obradi podataka za 1000 genoma [19]. Učestalost alela varira u različitim populacijama. Međutim, među populacijom kana podrijetlom iz Južne provincije i nastanjivanjem na Istoku, Južnoj i Središnjoj Kini, učestalost SS genotipa rs12252 dosegla je 69%. Kao rezultat detaljne analize genetske strukture stanovništva i incidencije (smrtnosti) influence, autori zaključuju da visoka učestalost HS genotipa doprinosi epidemiologiji gripe u Kini. Doista, u Kini je registrirana visoka učestalost velikih izbijanja gripe, što često dovodi do pandemije.

U vezi s otkrivenim korelacije genotipa i IFITM3 rs12252 infekcije influencom klinički je od interesa za proučavanje pojedine komponente „citokin oluja” u bolesnika s varijantom gena IFITM3 [21]. Ove studije provedene su u pacijenata inficiranih s kruži u ovom stupnju patogenog soja virusa influence A (H7N9). analizirana ekspresiju sljedećih oznaka „oluja citokina»: MPC-1 (monocit kemoatraktant protein-1), IL-1β (interleukin-1β), IL-6, IL-8, IL-10, TNF-α (Tumor Nekrotizirajući Faktor), IFN-γ i C-reaktivni protein [27]. Autori su proučavali sadržaj tih proteina u perifernoj krvi. Kao rezultat, nađeno je da su pacijenti s razinom CC genotipa sintezu i sekreciju proteina MPC-1 je značajno viši od bolesnika s CT ili TT genotipovima (Sl. 3). I težina bolesti izravno je povezana s tim pokazateljima - HS genotip i prekomjernu nespecifičnu imunološku reakciju. Nadalje, autori studije citokina (MIP-1 a, MIP-1, IL-1, IL-6 i IL-8) u pluća pacijenata koji su umrli. Pokazalo se da je sadržaj nekih proupalnih citokina 100-1000 puta veći u plućima u usporedbi s perifernom krvi. Tako, mutacija gena IFITM3 rs12252 potiče razvoj "citokinske oluje".

Zaključno, uloga polimorfizma IFITM3 gena u infektivnoj patologiji treba napomenuti da SNP rs12252 pridonosi razvoju Kawasaki bolesti - ranog djetinjastog vaskulitisa [15]. Ova patologija je također karakteristična za određene grupe stanovništva u jugoistočnoj Aziji i može dovesti do takve ozbiljne komplikacije kao aorte aneurizma [28]. Treba napomenuti da infekcija gripe izaziva vaskulitis, uključujući cerebrovaskularne infekcije, a to omogućava da preuzme utjecaj infekcije gripe na razvoj kardiovaskularne patologije.

Polimorfizam gena koji dodatno doprinose teškom tijeku infekcije

Istraživanje polimorfizma gena za razumijevanje predispozicije za zarazne bolesti i njihov teški tijek od temeljne su važnosti za pedijatrijsku praksu i globalne epidemijske procese [9, 14, 17]. Repertoar gena, koji u određenoj mjeri određuje razvoj komplikacija influence, značajno se proširio tijekom godina [9, 17]. Tablica 1 prikazuje popis ovih gena i njihov vjerojatan doprinos kršenju određenih funkcija u iskorjenjivanju influence i drugih virusnih infekcija.

gen

Funkcija kodiranog proteina

mana

veza

Antivirusni faktor zaštite na endosomskoj razini

Defekt unutarstanične antivirusne zaštite u ranoj fazi infekcije (endosomi)

Surfaktant protein B - plućni surfaktant

Zaštita pneumocita, stabilnost alveola, transport kisika i uklanjanje virusa i bakterija

Fc-receptor - faktor čišćenja zaraznog virusa

Nedostatak čišćenja virusa

Faktor komplementarnog sustava

Nedostatak komplementarnog sustava i citoliza ovisnih o komplementu zaraženih stanica

Faktor ubrzanja za propadanje komplementa, antigena sustava Cromer krvne grupe

Nedostatak kongenitalnih mehanizama zaštite pluća od lezija posredovane komplementom u infekciji gripe

Mezozo-vezujuće stanično lektin

Nedostatak regulacije urođenog imuniteta

Suzbijanje citokina ovisnih signalnih sustava

Nedostatak u kontroli sinteze i aktivnosti citokina (mogući razvoj "citokinske oluje")

Kompleks Se ovisnih enzima

Nedostatak antioksidacijskog sustava

Tablica 1. Geni, mutacije i polimorfizmi koji dovode do kompliciranog tijeka infekcije gripe

Proteini plućnog površinski aktivnog sredstva imaju najvažnije funkcije ne samo u osiguravanju stabilnosti kisika, nego iu antibakterijskoj i antivirusnoj zaštiti. Dugotrajna klinička ispitivanja pokazala su da polimorfizam gena koji kodiraju surfaktantne proteine ​​i osobito B protein (SP-B) igra ključnu ulogu u osjetljivosti na infekcije poput influence [29]. Također je utvrđeno da je polimorfizam SP-B gena povezan s teškim tijekovima infekcije uzrokovanim respiratornim sincicijskim virusom [30].

Poznata je uloga čimbenika faktora komplementa u bakterijskim i virusnim infekcijama. U tom smislu posebnu pažnju zaslužuju podatke o ulozi polimorfizma u C1QBP gena (Dopuna komponente 1, Q podkomponentu Binding Protein) u komplikacija gripe [8, 33]. C1QBP gen kodira C1QBP protein, koji je u zrelom obliku homotrimer. C1QBP homotrimer struktura značajka sastoji se u činjenici da ima asimetričnu raspodjelu naboja na površini molekule. Protein dolazi u interakciju s nizom molekula uključenih u regulaciju imunog sustava: CDK13 [38], kuna [39], VTN [40], NFYB [41], FOXC1 [42], DDX21, DDX50, NCL [43], SRSF1, SRSF9 [44], CDKN2A [45] i drugi proteini, uključujući CD93 [46]. C1QBP funkcija ovisna o antitijelu citolizu zaraženih stanica, aktivacije komplementa i fagocitoza. Protein akumulira u mitohondrijima u procesu viralne infekcije i inhibira ovisnu RLR (RIG-I kao receptori) prijenosu signala kroz interakciju s antivirusnim protein MAVS (mitohondrijske antivirusno-signalizacija protein). C1QBP protein je uključen u aktivaciju koagulacijske kaskade krvi [47]. Djelovanje C1QBP je pleiotropno i ovisi o stupnju infekcije.

CD55 (faktor za ubrzavanje propadanja kompleksa; DAF) faktor ubrzavanja propadanja komplementa, antigena Cromerovog sustava krvnih grupa. DAF / CD55 provodi antiinflamatorne funkcije, štite stanice od oštećenja iz komplementarnog sustava, a također kontrolira migraciju leukocita upalnim fokusom [47]. DAF / CD55 se eksprimira u vaskularnom endotelu, mononuklearnim stanicama periferne krvi i epitelnim stanicama (uključujući epitelij pluća i endometrij) [48]. CD55 potiskuje aktivaciju komponenata C3 i C5 komplementarnog sustava [49]. Značajna razina ekspresije CD55 u respiratornom epitelu naglašava važnost zaštite pluća od oštećenja uslijed prekomjerne aktivacije komplementarnog sustava. Zanimljivo je napomenuti da je razina ekspresije CD55 regulirana progesteronom i estrogenom [50].

SNP u promotoru CD55 gena (rs2564978 genotip T / T) povezan je s teľim tijekom gripe influence A (H1N1) pdm09 [34]. Pokusima in vitro utvrđeno je da infekcija stanica virusom influence A (H1N1) pdm09 uzrokuje povećanje ekspresije CD55 proteina. U bolesnika s genotipom T / T rs2564978, razina CD55 na površini mononuklearnih stanica periferne krvi značajno je smanjena u usporedbi s bolesnicima s C / C i C / T genotipima [51].

Aktivacija sustava komplementa značajno doprinosi oštećenju plućnog tkiva u slučaju infekcije gripe. U plućima miševa inficiranih sa virusom influence A (H5N1), otkrivena visoka C3, C5b-9, MBL, i za davanje C3aR antagonist značajno smanjuje upalu u tkivu pluća, [52].

Mutacija u promotoru CD55 gena, očito dovodi do smanjenja njegove ekspresije, poremetila je urođene mehanizme zaštite pluća od ozljede posredovanih komplementom u infekciji gripe, povećavajući rizik od teških bolesti i smrti.

U okviru razmatranja problema polimorfizma ljudskih gena i njihove povezanosti s teškim tijekovima infekcije gripe, problem posljedica neadekvatnog odgovora urođenog imuniteta na infekciju jasno je na prvom planu. Poznato je da aktivacija transkripcije gena koji kodiraju proinflamatorne citokine igra važnu ulogu u patogenezi komplicirane gripe [21].

S tim u vezi, posebno je zanimljiv sustav genetske kontrole reakcije urođenog imuniteta na infekciju gripe i funkcije gena uključenih u negativnu regulaciju ekspresije gena koji kodiraju proupalni citokini. SOCS4 gen (Suppressor of Cytokine Signaling 4) zauzima jedno od ključnih položaja u hijerarhiji genetske kontrole aktivacije sinteze proinflamatornih citokina [36].

Prirodni su interesi u genetskoj kontroli tih procesa prirodnim čimbenicima. Nedavno je utvrđeno da obitelj gena SoCs igraju važnu ulogu u smislu odvraćanja nespecifičnog imunog odgovora na različite patogene. Konkretno, to se odnosi prije svega na protein SOCS4 - prigušivač citokin signalnih sustava 4. Kako negativni regulator kontrolu sinteze citokina, ovaj protein spada ključni čimbenici u zaštiti od prekomjernog upalnih odgovora na virusne infekcije. Supresorski proteini ove obitelji inhibiraju signalnog puta JAK / STAT, čime se regulira i jedinica urođeni imunološki odgovor [36].

SECISBP2 - gen koji kodira enzimatsku kompleks (Sec umetanje slijedu vezanja proteina 2), koji osigurava prekidač struktura proteina selenocysteine ​​[37]. Enzimi koji sadrže selenocysteine, dio zaštite sustava redoks stanica protiv kisikovih radikala. Stvaranje kisikovih radikala - stanica je reakcija većine patogenih mikroorganizama, uključujući viruse [37]. U prisutnosti genetske mutacije u sintezi genske amplifikacije SECISBP2 reaktivnih vrsta kisika dovodi do povećanja osjetljivosti stanica na sustav inzulina koja se javlja, na primjer, u miševa s knockout gen koji kodira selenom antioksidans enzim glutation peroksidaze I. klinički u ljudi nosač SECISBP2 mutacije očituje Azoospermia aksijalna mišićnu distrofiju, povreda proliferaciju T-limfocita i općenitom imunosupresijom. Nositelji ovih mutacija ima visoku razinu lipidne peroksidacije i oksidativnim oštećenjem DNK, smanjujući reparativni potencijal oštećenja DNA i telomera skraćivanje. Pleiotropskim efektima mutacija u genu naziva SECISBP2 disfunkcija selenoproteoma sve [37]. Naravno, ta naslijeđena mana trebao bi se pojaviti posebno akutne u slučaju gripe, te razvoj upale pluća gripe. Poznato je da se antioksidans gripe terapija može ostvariti značajne terapijske učinke u odnosu na oslobađanje od trovanja sindrom i prevencije kardiovaskularnih događaja [52].

rezultati

Razumijevanje genetskih polimorfizama u određenim genima omogućuje orijentirati na razvoj sistemsko liječenje gripe s naglaskom na fenotipskih manifestacija mutacija na temelju učestalosti nasljedne sklonosti teškim komplikacijama gripe među genetskih rizičnih skupina i opće populacije.

Unatoč mogućnosti rasprostranjenih utvrđenih mutacija unutar gena povezanih s povećanom osjetljivošću na gripe, treba priznati da je najvažniji faktor je učinkovitost prezentacije virusnih antigena unutar skupine stanovništva s različitim vrstama HLA [10, 12].

Smrtnost od gripe zabilježena je u akutnom razdoblju bolesti i obično na vrhuncu epidemije, a zatim kao "odgođena smrtnost" između 1 i 3 mjeseca nakon bolesti. Obično je smrtonosni ishod povezan s popratnim bolestima, obično kardiovaskularnom patologijom. Najčešće je srčani udar, moždani udar često se bilježi. Dakle, prilikom analize genetske podloge populacije, ti faktori također moraju biti uzeti u obzir.

književnost

1. Karpova LS, Sominina AA, Dmitrieva MN, Popovtseva NM, Stolyarova TP, Kiselev OI. Usporedba pandemije gripe u Rusiji u razdoblju 2009-10. s naknadnim epidemijama koje uključuju influenza A (H1N1) pdm09 (2011-2014). Epidemiologija i prevencija cjepiva 2014.; 79 (6), 8-9.

2. Monto AS. Rizik od sezonske i pandemijske gripe: izglede za kontrolu. Clin Infect Dis 2009; 48, Suppl 1, S20-5.

3. Taubenberger JK, Morens DM. 1918 Influenza: majka svih pandemija. Emerg Infect Dis 2006; 12,15-22.

4. AP Wagner, McKenzie E, Robertson C McMenamin J, Reynolds A, Murdoch H. automatizirani praćenje smrtnost u Škotskoj iz 2009. Euro Surveill 2013; 18, 20451.

5. Dawood FS, Iuliano AD, Reed C, MI Meltzer, Shay DK, Cheng PY, Bandaranayake D Breiman RF, Brooks WA, Buchy P, Feikin DR, Fowler KB, Gordon A, Hien NT, horby P, Huang QS, Katz MA, Krishnan A, R Lal, Montgomery JM, Molbak K, R Pebody, Presanis AM, Razuri H, Steens A, Tinoco Yo, Wallinga J, Yu H, Vong S, Bresee J Widdowson MA. Procjenjuje se globalna smrtnost povezana s prvih 12 mjeseci 2009. pandemijske influence A H1N1 cirkulacije virusa: studije modeliranja. Lancet Infect Dis 2012; 12, 687-95.

6. Davila J, G Chowell Borja-Aburto VH, Viboud C, Grajales Muniz C, Miller M. znatan morbiditet i mortalitet Pandemija A / H1N1 u Meksiku, Zima 2013-2014: postupno Dob Shift i ozbiljnosti. PLoS Curr 2014; 6.

7. Arankalle VA, Lole KS, Arya RP, Tripathy AS, Ramdasi AY, Chadha MS, Sangle SA, Kadam DB. Uloga domaćeg imunog odgovora i viralnog opterećenja u diferencijalnom ishodu infekcije virusom pandemijske H1N1 (2009) u indijskim bolesnicima. PLoS ONE 2010; 5.

8. Webb SA, Pettila V, I, Seppelt Bellomo R, Bailey M, Cooper, DJ Cretikos M, Davies, AR Finfer S, Harrigan PW, Hart, GK Howe B, IREDELL JR, McArthur C, Mitchell, I. Morrison S, Nichol AD, Paterson DL, Peake S Richards B, Stephens D, Turner a, Yung M. usluge Critical care i 2009 H1N1 gripe u Australiji i Novom Zelandu. N Engl J Med 2009.; 361,1925-34.

9. Oshansky CM, Thomas PG. Ljudska strana influence. J Leukoc Biol 2012; 92, 83-96.

10. Alexander J, P Bilsel, del Guercio MF, Marinkovich-Petrović A, Southwood S, S Stewart, ishioka G, Kotturi MF, J Botten Sidney J, Newman M, Sette A. Određivanje vezanja široke klase I HLA epitopa supertype kako bi se osigurala univerzalna pokrivenost virusa influence A. Hum Immunol 2010; 71, 468-74.

11. Hertz T, Oshansky CM, Roddam PL, DeVincenzo JP, Caniza MA, Jojich N, S Mallal, Phillips E, James I, ME Halloran, Thomas PG, Corey L. HLA djelotvornost ciljanja korelira s veličinom odgovor ljudskim T-stanica i s smrtnošću od infekcije influence A. Proc Natl Acad Sci U S A 2013; 110,13492-7.

12. Hertz T, D Nolan, James I, John M. Gaudieri S, Phillips E, Huang JC, Riadi G, Mallal S, N. Jojich Mapping lepeza domaćina patogena coevolution: HLA klase I vezanje te njegov odnos sa evolucijski očuvanje u ljudskim i virusnim proteinima. J Virol 2011; 85, 1310-21.

13. mjedi AL, Huang IC Benita Y, John SP, Krishnan MN Feeley EM, Ryan BJ, Weyer JL, van der Weyden L, Fikrig E, Adams DJ, Xavier RJ, Farzan M Elledge SJ. Virus H1N1, virus West Nile i virus denga groznice. Cell 2009; 139, 1243-54.

14. Hui DS, Hayden FG. Urednički komentar: Host i virusni čimbenici u nastalim infekcijama virusom gripe. Clin Infect Dis 2014; 58, 1104-6.

15. Bowles NE, Arrington CB, Hirono K, Nakamura T, Ngo L, Wee YS, Ichida F, Weis JH. Pacijenti sa Kawasakijevim bolestima koji su homozigotni za rs12252-C varijante interferona induciranog transmembranskog proteina-3 imaju značajno veću vjerojatnost za razvoj lezija koronarnih arterija. Mol Genet Genomic Med 2014; 2, 356-61.

16. Rowley AH, Baker SC, Shulman ST, Rand KH, Tretiakova MS Perlman EJ, Garcia FL, Tajuddin NF, Fox LM, Huang JH, Ralphe JC, Takahashi K, J Flatow, Lin S, Kalelkar MB, Soriano B, Orenstein JM. Ultrastrukturalne, imunofluorescencija, i RNA dokazi podupiru hipotezu o „novoj” virusa povezanog s Kawasaki bolest. J Infect Dis 2011; 203, 1021-30.

17. Horby P, Nguyen NY, Dunstan SJ, Baillie JK. Uloga genetike domaćina u osjetljivosti na influencu: sustavni pregled. PLoS ONE 2012; 7, e33180.

18. Everitt AR, Clare S, T Pertel John SP, pranje RS, Smith SE, Chin CR, Feeley EM, Sims JS, Adams DJ, Wise HM, Kane L, D Goulding, Digard P, Anttila V, Baillie JK, Walsh TS, Hume DA, Palotie a, Y Xue, Colonna V, Tyler-Smith C Dunning J, Gordon SB, Smyth RL, Openshaw PJ, Dougan G, mjed AL, P. Kellam IFITM3 ograničava morbiditeta i mortaliteta povezanog s gripom, Priroda 2012; 484, 519-23.

19. Zhang YH, Zhao Y, Li N, Peng YC, Giannoulatou E, Jin RH, Yan HP, Wu H, Liu JH, Liu N, Wang DY, Shu YL, Ho LP, Kellam P, McMichael A, Dong T. Genetska varijanta rs12252-C izazvana interferonom inducirana transmembranska proteina 3 povezana je s teškom influencom u kineskim osobama. Nat Commun 2013; 4, 1418.

20. Everitt AR, Clare S, McDonald JU, Kane L, K Harcourt, Ahras M, Lall A, C Hale, Rodgers A, Young DB, Haque A, Billker O, Tregoning JS, Dougan G Kellam P. Određivanje raspona od patogena osjetljivih na restrikciju ifm3 upotrebom modela izbačenog miša. PLoS ONE 2013; 8, e80723.

21. Wang Z, Zhang A, Wan Y, X Liu, Qiu C, Xi X, Y Ren, Wang J, Y Dong, Bao M, Li L, M Zhou, Yuan S, Sun J, Zhu Z, Chen L, li Q, Zhang Z, X Zhang, Lu s, Doherty PC, Kedzierska K, Xu J. Rani hypercytokinemia povezana s interferonom inducirane transmembranske protein-3 disfunkcije i prediktivne fatalne infekcije H7N9. Proc Natl Acad Sci U S A 2013; 111, 769-74.

22. Feeley EM, Sims JS, John SP, Chin CR, Pertel T, Chen LM, Gaiha GD, Ryan BJ, Donis RO, Elledge SJ, mjed AL. IFITM3 inhibira infekciju virusom influence A prevencijom citosolnog ulaska. PLoS Pathog 2011; 7, e1002337.

23. Wrensch F, Winkler M, Pohlmann S. IFITM, proteini koji inhibiraju MERS-koronavirus šiljati protein: dokaz za mehanizme neovisne o kolesterolu. Virusi 2014.; 6, 3683-98.

24. Wee YS, Round KM, Weis JJ, Weis JH. Interferon-inducibilni transmembranski proteini urođenog imunog odgovora djeluju kao organizatori membrane utječući na lokalizaciju i funkciju klatrina i v-ATPaze. Innate Immun 2012.; 18, 834-45.

25. Blaising J, Levy PL, Polyak SJ, Stanifer M, Boulant S, Pecheur EI. Arbidol inhibira ulazak virusom ometajući trgovinu ovisna o klathrinu. Antivirusni res 2013; 100, 215-9.

26. Cunningham F, Amode MR, Barrell D, Beal K, K Billis, Brent S, Carvalho-Silva D Clapham P, G Coates, Fitzgerald S, Gil L Giron CG, Gordon L, T Hourlier, Hunt SE, Janačekovu SH, Johnson N, Juettemann T, Kahari AK, Keenan S, Martin FJ, Maurel T, McLaren W, Murphy DN, Nag R, Overduin B, Parker A, Patricio M, Perry E Pignatelli M, Riat HS, Sheppard D, Taylor K, Thormann A, Vullo A, Wilder SP, Zadissa A, Aken BL, Birney E, Harrow J, Kinsella R, Muffato M, Ruffier M, Searle SM, Spudich G, Trevanion SJ, Yates A, Zerbino DR, Flicek P, Ensembl 2015. Nucleic Acids Res; 43, D662-9.

27. Ramirez-Martinez G, Cruz-lagunama A, Jimenez-Alvarez L Espinosa E Ortiz-Quintero B Santos-Mendoza T, Herrera MT, Canche-skupina E, Mendoza C Banales JL, Garcia-Moreno SA, Moran J, Cabello C Orozco L-Aguilar Delfin i, Hidalgo-Miranda a, S Romero, Suratt BT, Selman M, J. Zuniga sezonskog i ovim virusom H1N1 virusa izazivaju diferencijalna ekspresija SoCs-1 i i-RIG gena i citokin / kemokina u makrofagima. Cytokine 2013; 62, 151-9.

28. Mizuguchi M, Yamanouchi H, Ichiyama T, Shiomi M. Akutna encefalopatija povezana s influencom i drugim virusnim infekcijama. Acta Neurol Scand Suppl 2007; 186, 45-56.

29. Za KK, Zhou J, Song YQ, Hung IF, IP WC, Cheng ZS, Chan AS, Kao RY, Wu AK, Chau S, Luk WK, IP MS Chan KH, Yuen KY. Polimorfizam proteina B surfaktanta povezan je s teškom influencom. Prsa 2014.; 145: 1237-43.

30. Puthothu B, Forster J, J Heinze, Heinzmann A, Krueger M. površinski protein B polimorfizmi povezani s teškim respiratornim sincicijskim virusom, ali ne i kod astme. BMC Pulm Med 2007; 7, 6.

31. Zarychanski R Stuart TL, Kumar A, Doucette S, Elliott L, J Kettner, Plummer F. KORELATI teške bolesti u bolesnika s 2009 virusna bolest (H1N1), virusne infekcije. CMAJ 2010; 182, 257-64.

32. Worgall S, P Bezdicek Kim MK, Park JG, Singh R Christofidou-Solomidou M princ A, Kovesdi I, Schreiber AD, Crystal RG. Povećanje obrane pluća domaćina protiv Pseudomonas pomoću FcgammaRIIA cDNA prijenosa u respiratorni epitel. J Clin Invest 1999; 104, 409-18.

33. La Ruche G, Tarantola A, Barboza P, L Vaillant, Guéguena J Gastellu-Etchegorry M. The 2009 pandemijski H1N1 influence i autohtone populacije Amerika i Pacific. Euro Surveill 2009; 14.

34. Zhou J, KK, Dong H, Cheng ZS, Lau, CC Poon VK, Fan YH, Song, YQ Tse H, Chan KH, Zheng BJ, Zhao GP, Yuen KY. Funkcionalna varijacija u CD55 povećava ozbiljnost infekcije virusom pandemijske gripe H1N1 iz 2009. J Infect Dis 2012; 206, 495-503.

35. Zuniga J Buendia-Roldan I, Zhao Y, Jimenez L, Torres D, J Romo, Ramirez G Cruz A, Vargas-Alarcon G, CC Sheu, Chen F, L Su, Tager AM, Pardo A, Selman M, Christiani DC. Genetske varijante povezane s teškom upalom pluća u infekciji influence A / H1N1. Eur Respir J 2011; 39, 604-10.

36. Kedzierski L, Linossi EM, Kolešnik TB, Dan EB, Bird NL, Kile BT, Belz BT, Metcalf D, Nicola NA, Kedzierska K, Nicholson SE. Supresor citokina signalizaciju 4 (SOCS4) štiti od velike oluje citokina i pojačava klirens virusnih tijekom infekcije influencom. PLoS Pathog 2014; 10, e1004134.

37. Schoenmakers E, M Agostini, Mitchell C Schoenmakers N, Papp L, Rajanayagam O, R Padidela, Ceron-Gutierrez L Doffinger R, Prevosto C, Luan J, Montano S, Lu J, M Castanet, Clemons N, Groeneveld M, P Castets, Karbaschi M, S Aitken, Dixon A, Williams J Campi I, Blount M, Burton H, F Muntoni, O'Donovan D, Dean A, Warren A, Brierley C, D Baguley, Guicheney P, Fitzgerald R, Coles A, Gaston H, Todd P, Holmgren A, Khanna KK, Cooke M Semple R, Halsall D Wareham N, Schwabe J, Grasso L, Beck-Peccoz P, Ogunko A, Dattani M, Gurnell M Chatterjee K. Mutacije u selenocysteine ​​umetanje sekvence veznog proteina 2 gena dovode do deficijencije multisistemska selenoprotein poremećaja u ljudi. J Clin Invest 2010; 120, 4220-35.

38. Čak i Y, Durieux S, Escande ML, Lozano JC, Peaucellier G, Weil D, Geneviere AM. CDC2L5 i Cdk slična kinaza s RS domenom, interakciju s ASF / SF2-povezanim proteinom p32 i utječe na spajanje in vivo. J Cell Biochem 2006; 99, 890-904.

39. Sunayama J, Ando Y, Itoh N, Tomiyama A, K Sakurada, Sugiyama A, Kang D, Tashiro F, Gotoh Y, Y Kuchino, Kitanaka Fizička i funkcionalne interakcije BH3 samo proteina kuna i mitohondrijske tvorbu pora protein p32. Smrt stanica razlikuju se 2004; 11, 771-81.

40. Lim BL, Reid KB, Ghebrehiwet B, Peerschke EI, Leigh LA, Preissner KT. Vezujući protein za globularne glave komplementa C1q, gC1qR. Funkcionalna ekspresija i karakterizacija kao novi vitronektin vezujući faktor. J Biol Chem 1996; 271, 26739-44.

41. Chattopadhyay C, Hawke D, Kobayashi R, Maity SN. Ljudski p32, djeluje u interakciji s B podjedinicom CCAAT-vezujućeg faktora, CBF / NF-Y, i inhibira CBF-posredovanu transkripciju aktivacije in vitro. Nucleic Acids Res 2004; 32, 3632-41.

42. Huang L, Chi J, Berry FB, Footz TK, Sharp MW, Walter MA. Ljudski p32 je novi protein koji interpretira FOXC1 koji regulira FOXC1 transkripcijsku aktivnost u okularnim stanicama. Invest Ophthalmol Vis Sci 2008; 49, 5243-9.

43. Yoshikawa H, Komatsu W, T Hayano, Miura Y, Homma K, K Izumikawa, Ishikawa H Miyazawa N, Tachikawa H, Y Yamauchi, Isobe T, Takahashi N. Spajanje faktor 2-povezan protein p32 sudjeluje ribosoma biogeneze po regulira vezanje Nop52 i fibrillarin na preribosome čestice. Mol Cell Proteomics 2011; 10, M110 006148.

44. Petersen-Mahrt SK, Estmer C Ohrmalm C, Matthews DA, Russell WC, Akusjarvi G. spajanje faktor povezan s protein, p32 regulira RNA spajanje inhibicijom ASF / sf2 RNA vezanje i fosforilacija. EMBO J 1999; 18, 1014-24.

45. Reef S, Shifman O, Oren M, Kimchi A. Autofagični induktor smARF interakcionira i stabilizira s mitohondrijskim p32 proteinom. Oncogene 2007; 26, 6677-83.

46. ​​Ghebrehiwet B, Lu PD, Zhang W, Keilbaugh SA, Leigh LE, Eggleton P, Reid KB, Peerschke EI. Dokaz da se dva C1q vezujuća membranska proteina, gC1q-R i cC1q-R, povezuju kako bi se formirao kompleks. J. Immunol 1997; 159, 1429-36.

47. Sakuma M, Morooka T, Wang Y, Shi C, Croce K, Gao H, Strainic M, Medof ME, Simon DI. Intrinzični regulator faktora propadanja-ubrzavanja modulira biološki odgovor na vaskularnu ozljedu. Arterioscler Thromb Vasc Biol 2010; 30, 1196-202.

48. Uhlen M. Fagerberg L, Hallstrom BM, Lindskog C Oksvold P, Mardinoglu A, Sivertsson A, Kampf C Sjostedt E Asplund A, Olsson I, K Edlund, Lundberg E Navani S, Szigyarto CA, Odeberg J, Djureinovic D Takanen JO, Hober S, Alm T, Edqvist PH, Berling H, Tegel H, Mulder J, Rockberg J, Nilsson P, Schwenk JM, Hamsten M, von Feilitzen K, Forsberg M, Persson L Johansson F, Zwahlen M, von Heijne G, J Nielsen, Ponten F. Proteomics. karta tkiva na bazi ljudskog proteoma. Znanost 2015.; 347, 1260419.

49. Kuttner-Kondo LA, Mitchell L, Hourcade DE, Medof ME. Karakterizacija aktivnih mjesta u čimbeniku ubrzavanja propadanja. J Immunol 2001; 167, 2164-71.

50. Nowicki B, Nowicki S. DAF kao terapeutski cilj za steroidne hormone: implikacije za interakcije domaćina i patogena. Adv Exp Med Biol 2013; 735, 83-96.

51. Shang Y, Chai N, Gu Y, L Ding, Yang Y, Zhou J, Ren G, X Hao, Fan D, Wu K, Nie Y. Sustavna imunohistokemijska analiza ekspresije CD46, CD55, CD59 i u debelom crijevu rak. Arch Pathol Lab Med 2014; 138, 910-9.

52. Sun S, G Zhao, Liu C, Wu X, Y Guo, Yu H, H Song, Du L, Jiang S, Guo R, S Tomlinson, Zhou Y. Inhibicija aktivacije komplementa ublažava akutna ozljeda pluća induciranu visoko patogeni infekcije virusom influence ptica H5N1. Am J Respir Cell Mol Biol 2013; 49, 221-30.

Napisano je na obitelji

Zašto je gripa za neke ljude banalna bolest, a za druge smrtonosna bolest?

Prema riječima stručnjaka, čiji se podaci značajno razlikuju od službene statistike, svake godine u Rusiji, oko tri milijuna ljudi pati od gripe. Za njih 20.000 ova infekcija postaje smrtonosna. Zašto je to za neke gripe - banalna slabost, ali za druge - ozbiljna bolest s ozbiljnim komplikacijama? Međunarodna skupina virologa iz istraživačkih institucija u Ujedinjenom Kraljevstvu i Sjedinjenim Državama približila se tom pitanju.

Već je poznato tko pati od gripe češće: djeca, starije osobe i oni koji već imaju kronične bolesti su u opasnosti. Međutim, nije neuobičajeno situacija kada gripa s teškim komplikacijama doslovce spušta sredovječnog čovjeka koji je prije bio izvrsan u zdravstvu. Tijekom svinjske gripe H1N1 u 2009-2010, takvi slučajevi bili su posebno visoki. Svjetska zdravstvena organizacija tada je utvrdila da je većina ljudi s gripe imala umjerene simptome, a oni koji su imali poteškoća s bolestima i hospitalizirani su bili samo 5-7 posto. No, 40 posto ljudi koji su preminuli s teškim komplikacijama bili su upravo pješaci - nisu imali nikakvih čimbenika rizika. Među onima koji su umrli od gripe, gotovo isti broj. Druga čudotvornost: virus koji je postao relativno bezopasan za većinu svjetske populacije, na nekim je mjestima iskopao isključivo rodbinu - članove jedne ili druge obitelji. Mnogi su sumnjali da su mutacije patogena odgovorne za sve. Međutim, sve se ispostavilo drugačije.

Znanstvenici na Wellcome Trust Sanger Instituta u Velikoj Britaniji i Instituta Ragon na središnje bolnice Massachusetts u SAD-u odlučili su istražiti problem, pozivajući se na mehanizmima urođene imunosti. „Kada ljudi govore o imunološkom sustavu, najčešće imaju na umu adaptivni imunitet: U odgovoru na patogene ući u tijelo proizvodi specifični za svaki od ovih antitijela, koja se obučeni da reagiraju na njih - kaže imunolog poznati ruski akademik RAS i ovnova Rem Petrova. - Sada je, međutim, privuklo pozornost znanstvenika je još jedan, još drevni sustav imuniteta, što omogućuje tijelu da se brzo odražavaju invaziju svakoga, čak i potpuni stranac neprijatelja. Pod urođene imunosti značilo kaskadu imunoloških reakcija sljedećih jedna drugu. - jedan korak uključuje nakon druge "

U području gledišta međunarodne skupine znanstvenika koji istražuju prirodu influence, ima takozvani interferon-inducibilni transmembranski protein IFITM3. "Kao što njegov naziv implicira, ovaj protein tijekom imunog odgovora počinje raditi nakon interferona, što daje signal o prisutnosti infekcije u tijelu", - kaže Rem Petrov. Eksperimenti sa staničnim kulturama in vitro pokazali su važnu funkciju u IFITM3. Kada strani virus uđe u tijelo tijela, to je protein koji mu ne dopušta da se presele u jezgru, gdje bi mogao započeti mehanizam razmnožavanja virusa i time zaustaviti razvoj infekcije. Ebraham Brass Instituta Ragon pokazala je da IFITM3 blokira umnožavanje virusa u staničnim kulturama. Međutim, in vitro i in vivo - u stvari, dva različita svijeta. Ono što se nalazi u petrijevoj posudi pod mikroskopom ne mora nužno raditi u živom tkivu. Prema Paulu Kellamu s Instituta Senger, znanstvenik je konačno uspio saznati da IFITM3 stvarno oblikuje u tijelu odlučujuću liniju obrane od gripe. Ali prije toga, Kellam i Brass morali su provesti niz eksperimenata.

Prvo, istraživači su odlučili testirati svoju hipotezu na laboratorijskim životinjama. Da bi to postigli, uzeo je posebnu liniju transgenskih miševa s "isključenim" IFITM3 genom i kontrolnom skupinom konvencionalnih miševa. Nakon što su inficirali obje skupine bezopasnim virusom niske patogene influence, počeli su čekati rezultat. Konvencionalni miševi su pretrpjeli infekciju dobro. Brzo su se oporavili, gotovo bez gubitka težine. Ali transgenični miševi su bili jako loši. "Nedostatak IFITM3 proteina dovodi do prolazne pneumonije. Šteta koju je prouzročila vrlo je podsjetila na sliku koja je zabilježena 1918. godine kod infekcije ljudi visoko patogenih virusa "Španjolaca", - autori istraživanja. U šest dana transgenični miševi izgubili su četvrtinu njihove težine, a količina virusa otkrivena u njihovim plućima bila je deset puta veća od normalnih miševa. Naravno, nitko ne bi stavio takve ubojite pokuse na ljude. Stoga je, za sada, pitanje kako kvar gena koji kodira za IFITM3 protein utječe na širenje gripe kod ljudi ostao otvoren.

Rješenje je pronađeno kada su znanstvenici odlučili krenuti od suprotnog. Zapravo, ako ne možete skupiti skupinu ljudi s nedostatcima u proteinu IFITM3 i provjeriti im učinak virusa, zašto onda ne pažljivo pogledati one koji su već patili od gripe tijekom epidemije? Istraživači su odabrali 53 osobe od onih koji su ušli u bolnicu s najgorim simptomima svinjske gripe i analizirali svoj genom. Ispalo je da je za većinu gena koji kodira IFITM3 protein apsolutno normalan. Međutim, rezultat studije i dalje je impresivan. Uostalom, pokazalo se da je mala grupa ljudi koja je imala gripu bila vrlo teška, pa je ovaj gen bio slomljen: odgovarajući protein je bio kraći od uobičajenog, s 21 aminokiselinom i zbog toga je funkcionirao na pogrešan način. To je sve o proporcijama. Oni koji su pronašli gensku mana bili su 5,7 posto među onima koji su pogođeni grijanjem. I u prosjeku stanovništva genetska mana se susreće s učestalošću od 0,3 posto. To jest, među žrtvama bilo je desetaka puta više ljudi s genskom slomom nego u cjelini za stanovništvo. Uspostavljena je veza. Međutim, istraživači su se promijenili ako nisu pokušali potvrditi ove podatke.

Da bi to učinili, ponovno su se vratili u stanične kulture in vitro. U ovom trenutku, to je samo tri vrste stanica: one s proteinima IFITM3 je normalno, one s kojima je on bio odsutan, i one u kojima je protein je skraćen za 21 aminokiselina. Kada su istraživači pokrenuli virus u epruvete, rezultat nije dugo dolazio. "Normalni" proteini IFITM3, kao i obično, odmah je stavio liniju obrane protiv patogena. Ali skraćeni proteini ovog gena bili su vrlo loši borci u borbi protiv gripe. Njegova citadela - jezgra ćelije - prošla je gotovo bez borbe, dopuštajući virusu da se razmnoži. Rezultat eksperimenta gotovo se nije razlikovao od onoga što je učinjeno s stanicama bez važnog proteina. Dakle, uzrok ozbiljnih komplikacija influence tijekom epidemije može doista biti skraćen IFITM3.

„Znanstvenici su uspjeli otkriti jedan od temeljnih mehanizama infekcije sukoba”, - kaže direktor Instituta za istraživanje gripe ovnova Oleg Kiselev. Čini se da u medicinskim i genetskim centrima već gradi liniju pacijenata. S jedne strane, o opasnostima i prednostima cijepljenja u zadnjih nekoliko godina ne samo da kaže da je lijen, a drugi - protiv gripe, mi u osnovi je izbjeći ozbiljne komplikacije. Čini se da je pronađeno sredstvo za identificiranje onih kojima su cijepljenje od vitalne važnosti. Međutim, upozoravaju stručnjaci: sve dok krajnja jasnoća još uvijek nije daleka. Podsjećamo na brojke iz eksperimenta: kvar IFITM3 pronađen je u 5,7 posto pacijenata koji su bili porazili gripe. To znači da 94,3 posto slučajeva ozbiljnih komplikacija influence još uvijek ostaje misterij za nas. „U složenom ansambla urođene imunosti, znanstvenici još nisu bili u mogućnosti da se igra samo jedan alat - kaže Rem Petrov. "Moramo detaljno pogledati i druge imune odgovore." Međutim, ono što kažete, rezultat je već napisan, i to je dosta. „Uzmi još jedan mali korak prema personalizirane medicine u budućnosti”, - kaže prorektor State University Novosibirsk, dopisni član Ruske akademije znanosti Sergeja Netyosov. A sada možemo sanjati o tome kada genetska analiza postaje jeftinije i pristupačnije postupke, liječnici će biti u mogućnosti da lako odabrati iz cijele populacije od 0,3 posto onih kojima zbog slomljenog gena IFITM3 gripa je smrtonosna. I štitite ih od sezonskih bolesti svim dostupnim sredstvima - uključujući uz pomoć cjepiva. Ovaj pristup se više ne čini fantastičnim.

Imunitet se može boriti protiv bolesti jetre

Jetra prima ne samo arterijsku krv bogatu kisikom iz jetrene arterije, već i vensku krv koja teče iz crijeva, s portalnom venom. A to znači da je jetra važan organ na putu infekcije koja se širi krvlju.

Za suzbijanje infekcije, jetra sadrži različite imunološke stanice koje su uključene u otkrivanje i hvatanje patogena u krvi. Sve od tih stanica - sudionici velikog koordiniranog programa imunološkog odgovora s ciljem uklanjanja štetnih uzročnika, privlačenje dodatnih vojnika iz bijelih krvnih stanica (leukocita) i generiranje signala opasnosti nastao. Osim toga, jetra može razlikovati doista štetne inozemne agense od zajedničkih inozemnih agenata koji dolaze s hranom.
Dakle, jetra je održavati ravnotežu između osiguravanja kontrolu imunološkog odgovora, a za njegovu pretjerane reakcije, što je - uz mnoge druge funkcije - važan organ koji pomaže imunološki sustav. Zato je važno voditi računa o jetri i ne zaboraviti na njegovu potrebu za zdravom prehranom, vitaminima, esencijalnim fosfolipidima i mikroelementima.
Nastavlja se proučavati uloga jetre u stvaranju imunološkog odgovora usmjerenog na zaštitu od stranih sredstava. Na primjer, 2015. godine, znanstvenici sa Sveučilišta u Adelaideu (Australija) otkrili su ulogu obitelji gena koji potiskuju razvoj hepatitisa C u jetri. Rezultati istraživanja objavljeni su u Časopis za biološku kemiju.
Virus Hepatitis C je ozbiljan problem u Australiji i širom svijeta, oko 223.000 Australaca zaraženo je virusnim hepatitisom C, koji se prenosi zaraženom krvlju. Nevidljiva infekcija može dovesti do kroničnih bolesti i raka jetre - i oba stanja se češće susreću.

Istraživači su prvo pokazali da antivirusni proteini IFITM, koji imamo vlastiti imunološki sustav, mogu spriječiti prodiranje virusa hepatitisa C u stanice.
Profesor Michael Beard, voditeljica laboratorija patogenezi virusnih bolesti, komentirao je: „Sada smo naučili mnogo o tome kako proteini IFITM rad u jetri i kako suzbiti virus hepatitisa C bolje razumijevanje tijela reakcija na uvođenje virusa, možemo razviti nove metode liječenja: kako bi se poboljšala reakciju tijela ili imitaciju, kako bi točno uništili viruse. "
Ranije laboratorijski eksperimenti pokazali su da proteini IFITM1, IFITM2 i IFITM3 mogu umanjiti infekcije uzrokovane različitim virusima, uključujući i virus hepatitisa C, no uloga tih proteina ostao misterij sve do nedavno, u suzbijanju infekcije.
Profesor Bird i diplomirani student Sumud Narayana proučavali su učinak tih bjelančevina na hepatitis C viruse u jetrenim stanicama. Uspjeli su pokazati da stanice jetre koje sintetiziraju veliki broj IFITM proteina su otporne na infekciju virusom, jer ih ne dopuštaju prodrijeti unutra.
Znanstvenici su pokazali interakciju između ovih proteina i virusa koji pokušavaju ući u stanicu. Očigledno, za suzbijanje virusa, proteini rade zajedno. Ti podaci otvaraju nove načine sprječavanja razvoja virusnog hepatitisa.

Interferon-inducirani transmembranski protein 3

IFITM3

Napomena: 5 od 5

Ocjena bilješke pruža heurističku mjeru sadržaja bilježenja UniProtKB ulaza ili proteoma. Ovaj rezultat ne mogu se koristi kao mjera točnosti napomena.

- Eksperimentalni dokazi na razini proteina i

To ukazuje na vrstu dokaza koji podupire postojanje proteina. Imajte na umu da "postojanje proteina" ne daje informacije o točnosti ili ispravnosti prikazanih sekvenci (a).

Odaberite odjeljak s lijeve strane da biste vidjeli sadržaj.

Ovaj odjeljak pruža korisne informacije o proteinu, prvenstveno biološkom znanju.

Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

Projekt Ontologija gena (GO) pruža skup hijerarhijskog kontroliranog rječnika podijeljenog u tri kategorije:

GO - Biološki proces i

  • obrambeni odgovor na virus Izvor: UniProtKB

Odbačeno iz izravnog testa

Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

Izostavljena izravna analiza i

  • 21478870
  • imunološki odgovor Izvor: ProtInc

    Izjava o autorskom pravu sljedivosti

    Upotrebljava se za informacije iz članaka s pregleda, gdje se izvorni eksperimenti mogu pratiti kroz taj članak, kao i za informacije iz tekstovnih knjiga ili rječnika.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Izostavljena izravna analiza i

    • 21253575
  • odgovor na virus Izvor: UniProtKB

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    UniProtKB Ključne riječi: kontrolirani vokabular s hijerarhijskom strukturom. Ključne riječi sažimaju sadržaj UniProtKB unosa i olakšavaju traženje proteina od interesa.

    Baza podataka enzima i putova

    Reactome - baza znanja o biološkim putevima i procesima

    Obiteljske / skupne baze podataka proteina

    Baza podataka o klasifikaciji prijevoza

    Ovaj odjeljak daje informacije o imenu i sinonima proteina i gena i sinonimima i o organizmu koji je izvor sekvencije proteina.

    imena Taksonomija i

    Ovaj odjeljak odjeljka Imena i taksonomija pruža iscrpan popis svih naziva proteina, od običnih do zastarjelih, kako bi se omogućilo jednoznačno prepoznavanje proteina.

    Nazivi proteina i

    Ova pododjeljka odjeljka Imena i taksonomija upućuje na ime ili nazive gena koji kodiraju za sekvence proteina opisane u unosu. Postoje četiri zasebna znaka: 'Ime', 'Sinonimi', 'Redoviti nazivi lokusa' i 'ORF imena'.

    Ovaj odjeljak odjeljka Imena i taksonomija daje informacije o imenu ili organizmima koji su izvor proteinskog slijeda.

    Ovaj odjeljak odjeljka Imena i taksonomija prikazuje jedinstveni identifikator koji NCBI dodjeljuje izvoru proteina. To je poznato kao "taksonomski identifikator" ili "taxid".

    Taksonomski identifikator i

    Ovaj pododjeljak Imena i taksonomije sadrži taksonomsku hijerarhijsku klasifikaciju izvornog organizma. To su popisi čvorova koji se pojavljuju u taksonomskom stablu, s općenitijim grupiranjem na prvom mjestu.

    Taksonomska linija i

    Ovaj pododjeljak Imena i taksonomije dio je proteoma, tj. cijelog niza genijalaca potpuno su sekvencionirani.

    UniProt proteom može se sastojati od nekoliko komponenti.
    Naziv komponente odnosi se na genomsku komponentu koja kodira skup proteina.
    Oni se kreću od jedne komponente kao što su virusni genomi do nekoliko komponenti kao u slučaju eukariotskih kromosoma. Oni također mogu predstavljati različite faze u projektu genoma i uključuju komponente kao što su contigs, skela ili cijelog genoma puška (WGS) Magistarski zapisa.

    Komponenta i: kromosom 11

  • Baza podataka specifičnih za organizam

    Eukariotski resursi baze podataka patogena

    Baza podataka o nomenklatu ljudskog gena

    Online Mendelian nasljeđivanje u čovjeku (OMIM)

    neXtProt; platforma znanja o ljudskom proteinu

    Ovaj odjeljak sadrži informacije o lokaciji i topologiji zrelog proteina u stanici.

    Subcellularno mjesto i

    Ekstracelularnog područja ili se izlučuje citosolu plazma membrane Citoskelet Lizosom endosoma peroksisoma ER Golgijev aparat jezgre mitohondrija Manual napomena Automatski Graphics računski se utvrditi Christian Stolte; Izvor: POVRŠINA

    Plazma membrana
    Lizosom
    endozomu
    endozomu
    • kasna endozomna membrana Izvor: UniProtKB-SubCell
  • Lizosom
    • lizosomalna membrana Izvor: UniProtKB-SubCell
  • Plazma membrana
    • plazma membrana Izvor: UniProtKB

    Odbačeno iz izravnog testa

    Koristi se za označavanje izravnog testa za funkciju, proces ili komponentu naznačenu GO pojmom.

    Više informacija potražite u vodiču za kodeks dokaza za GO

    Ostale lokacije
    • integralna komponenta membrane Izvor: UniProtKB-KW

    topologija

    Ovaj pododjeljak odjeljka "Subcellular location" opisuje subcelularni odjeljak gdje se nalaze sve ne membranske regije membranskog proteina.

    Topološka domena i

    Ovo pododjeljak odjeljka "Subcellular location" opisuje opseg regije.

    Ovaj pododjeljak odjeljka "Subcellular location" opisuje subcelularni odjeljak gdje se nalaze sve ne membranske regije membranskog proteina.

    Topološka domena i

    Ovaj pododjeljak odjeljka "Subcellular location" opisuje opseg membrane koja obuhvaća područje proteina. Označava prisutnost alfa-heličkih transmembranskih regija i područja membranog obuhvaćanja beta-cijevnih transmembranskih proteina.

    Ovaj pododjeljak u odjeljku „” opisuje substaničnog adrese subćelijski odjeljak u kojem je pronađen je svaki ne-membrana regija proteina membrane pokrivanja.

    Topološka domena i

    UniProtKB Ključne riječi: kontrolirani vokabular s hijerarhijskom strukturom. Ključne riječi sažimaju sadržaj UniProtKB unosa i olakšavaju traženje proteina od interesa.

    Ključne riječi - Stanična komponenta i

    Ovaj odjeljak daje informacije o bolestima i fenotipovima povezanim s proteinom.

    patologija Biotech i

    Baza podataka specifičnih za organizam

    MalaCards baza podataka o humanoj bolesti

    Online Mendelian nasljeđivanje u čovjeku (OMIM)

    Baza znanja farmakogenetike i farmakogenomike

    Polimorfizam i baza mutacija

    BioMuta je kurirao jednu nukleotidnu varijaciju i bazu podataka udruga bolesti

    Mapiranje domena mutacija bolesti (DMDM)

    Ovaj odjeljak opisuje posttranslational modifikacije (PTMs) i / ili obradu događaja.

    PTM / obrada i

    Obrada molekule

    Ovaj pododjeljak odjeljka "PTM / obrada" opisuje opseg polipeptidnog lanca u zrelom proteinu nakon prerade.

    Lanac i PRO_0000153729

    Modifikacije aminokiselina

    Ovaj pododjeljak sekcije PTM / Obrada opisuje kovalentne veze različitih vrsta formirane između dva proteina (međulančanih poprečnih veza) ili između dvaju dijelova istog proteina (medulančane poprečnih veza), osim disulfidnih veza koje su obilježene u „disulfidu obveznica '.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj pododjeljak odjeljka PTM / obrada specificira položaj (e) i vrstu kovalentno vezane lipidne skupine.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj pododjeljak odjeljka PTM / obrada specificira položaj (e) i vrstu kovalentno vezane lipidne skupine.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj pododjeljak sekcije PTM / Obrada opisuje kovalentne veze različitih vrsta formirane između dva proteina (međulančanih poprečnih veza) ili između dvaju dijelova istog proteina (medulančane poprečnih veza), osim disulfidnih veza koje su obilježene u „disulfidu obveznica '.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj pododjeljak sekcije PTM / Obrada opisuje kovalentne veze različitih vrsta formirane između dva proteina (međulančanih poprečnih veza) ili između dvaju dijelova istog proteina (medulančane poprečnih veza), osim disulfidnih veza koje su obilježene u „disulfidu obveznica '.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj pododjeljak sekcije PTM / Obrada opisuje kovalentne veze različitih vrsta formirane između dva proteina (međulančanih poprečnih veza) ili između dvaju dijelova istog proteina (medulančane poprečnih veza), osim disulfidnih veza koje su obilježene u „disulfidu obveznica '.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj pododjeljak odjeljka PTM / obrada specificira položaj (e) i vrstu kovalentno vezane lipidne skupine.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj pododjeljak odjeljka PTM / obrada opisuje posttranslational modifikacije (PTMs). Ovo pododjeljivanje nadopunjuje informacije se daju na razini redoslijeda. podaci o položaju nisu još dostupni.

    Posttranslacijska modifikacija i

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    UniProtKB Ključne riječi: kontrolirani vokabular s hijerarhijskom strukturom. Ključne riječi sažimaju sadržaj UniProtKB unosa i olakšavaju traženje proteina od interesa.

    Ključne riječi - PTM i

    Proteomske baze podataka

    Enciklopedija dinamičke proteine

    PaxDb, baza podataka prosječnih obilježja proteina u svim tri domene života

    Bazu podataka za identifikaciju priznanja

    Konzorcij za Top Down Proteomics

    PTM baze podataka

    Integrirani IPTMnet resurs za PTM u kontekstu biologije sustava

    Iscrpan izvor za proučavanje proteina posttranslacijskih modifikacija (PTMs) u ljudi, miša i štakora.

    SwissPalm baza podataka o S-palmitoilacijskim događajima

    Ovaj odjeljak daje informacije o ekspresiji gena na razini mRNA ili proteina u stanicama u tkivima višestaničnih organizama.

    Ovaj pododjeljak u odjeljku „Expression” prenosi eksperimentalno dokazane učinke induktora i represori (najčešće kemijski spojevi ili čimbenika okoliša) na razini proteina (ili mRNA) izraz (up-regulacije, reguliranje, konstitutivnog izražavanja).

    Baze podataka o ekspresiji gena

    Bgee baze podataka za genetsku ekspresiju evolucije

    CleanEx baza podataka genskih ekspresijskih profila

    ExpressionAtlas, diferencijalna i osnovna ekspresija

    Genevisible portal za pretraživanje za normalizirane i obrađene ekspresijske podatke iz Genevestigatora

    Baza podataka specifičnih za organizam

    Atlas ljudskog proteina

    Ovaj odjeljak daje informacije o kvarternoj strukturi proteina i o interakciji s drugim proteinima ili protein kompleksima.

    Ovaj pododjeljak u odjeljku „” interakcija pruža informacije o proteinskoj kvartarne strukture i interakcija (a) s drugim proteinima ili proteinskih kompleksa (osim fizioloških receptor-ligand interakcije koje su obilježene u odjeljku „funkcija”).

    Struktura podjedinice i

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ova pododjeljka odjeljka "Interakcija" daje informacije o interakcijama binarnih proteina i proteina. Podaci prikazani u ovom odjeljku su kvalitetno filtrirani podskup binarnih interakcija automatski izvedenih iz IntAct baze podataka. Ažurira se mjesečno. Svaka binarna interakcija prikazuje se u zasebnoj liniji.

    Binarne interakcije i

    Baze podataka komunikacijskih proteina i proteina

    Biološka opća repozitorij za interakcijske podatke (BioGrid)

    Baza podataka interakcije proteina i sustav analize

    Molekularna INTeraction baza podataka

    STRING: mreže za povezivanje funkcionalnih proteina

    Ovaj odjeljak daje informacije o tercijarnoj i sekundarnoj strukturi proteina.

    Baze podataka 3D strukture

    Portal proteinskog modela baze PSI-Nature strukturne biologije

    Baza podataka komparativne strukture proteina

    MobiDB: baza briznog poremećaja i bilježenja mobilnosti

    Ovaj odjeljak daje informacije o sličnosti sekvenci s drugim proteinima i domenama prisutnim u proteinu.

    obitelj Domene i

    regija

    Ovaj odjeljak "Obitelj i domene" opisuje područje interesa koje se ne može opisati u drugim pododjeljcima.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ovaj odjeljak "Obitelj i domene" opisuje područje interesa koje se ne može opisati u drugim pododjeljcima.

    Ručno obrađeni podaci za koje postoje objavljeni eksperimentalni dokazi.

    Ručna tvrdnja temeljena na eksperimentu u i

    Ova pododjeljka odjeljka "Obitelj i domene" daje informacije o sličnosti sekvence s drugim proteinima.

    Sekvenci sličnosti i

    UniProtKB Ključne riječi: kontrolirani vokabular s hijerarhijskom strukturom. Ključne riječi sažimaju sadržaj UniProtKB unosa i olakšavaju traženje proteina od interesa.

    Ključne riječi - Domena i

    Phylogenomic databases

    evolucijska genealogija gena: Nepodržane ortologne skupine

    HOGENOM baze podataka homolognih gena iz potpuno organiziranih organizama

    HOVERGEN baze homolognih generacija kralježnjaka

    InParanoid: Eukariotske ortodoksne skupine

    KOGG pravopis (KO)

    Identifikacija ortologa iz cjelokupnih genomskih podataka

    Baza ortoloških skupina

    Baza podataka za kompletne zbirke genetskih genoma

    TreeFam baza stabala životinjskih gena

    Obiteljske i domene baze podataka

    Integrirani izvor proteinskih obitelji, domena i funkcionalnih mjesta

    Baze podataka Pfam protein domena

    Ovaj odjeljak po defaultu prikazuje kanonsku sekvencu proteina i na zahtjev sve izooblike opisane u unosu. Ona također uključuje informacije relevantne za slijed (e), uključujući duljinu i molekularnu težinu.

    Ovaj pododjeljak odjeljka sekvenci određuje prema zadanim postavkama u unosu je potpuna ili ne.

    Status redoslijeda i: Dovršen.

    Checksum je oblik redundancije. Korisno je za ažuriranje redoslijeda praćenja.

    Treba napomenuti da, iako, u teoriji, dvije različite sekvence mogu imati istu vrijednost kontrolnog zbroja, vjerojatnost da će se to dogoditi je izuzetno niska.

    Međutim, UniProtKB može sadržavati zapise s identičnim sekvencama u slučaju višestrukih gena (paralogs).

    Kontrolna računa kao slijed 64-bitni cikličke redundancije (Provjera vrijednosti CRC64) pomoću generatora polinom: x 64 x + 4 + x + 3 x + 1. algoritam je opisano u ISO 3309 standardu.

  • Prethodni Članak

    ZDRAVA HRANA ZA RAK